K-CSI01 细胞种属鉴别检测试剂盒(多重PCR法)
试剂盒简介
细胞种属鉴别是生物制品生产用细胞基质质量控制要求之一,也是保障生物制品生产使用正确细胞基质、防止细胞误用或交叉污染的重要措施。雅心细胞种属鉴别检测试剂盒(多重PCR法)可用于对细胞基质的物种来源进行鉴定,以确认细胞系身份以及是否存在其他细胞系的污染。本试剂盒基于多重PCR法和电泳技术,通过扩增动物细胞线粒体细胞色素b、细胞色素氧化酶Ⅰ(COX Ⅰ)或细胞色素氧化酶Ⅱ(COX Ⅱ)基因,根据PCR扩增子的大小鉴别细胞种属来源和污染情况。本法适用于猪、人、猫、中国仓鼠、恒河猴、非洲绿猴、大鼠、犬、小鼠和牛的细胞种属鉴别。如已知供试品的细胞种属信息且在多重PCR法可检测的种属范围内,可选择多重PCR法进行鉴别并判定是否存在其他种属来源细胞的交叉污染。
试剂盒组分
规格:25 Reactions、50 Reactions
表1 试剂盒组分
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组分名称 |
组分编号 |
25 Reactions |
50 Reactions |
储存条件 |
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Cell Extraction Buffer |
CSI01-A |
1 mL × 2管 |
1 mL × 4管 |
-20±5℃ |
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Proteinase K (20 mg/mL) |
CSI01-B |
30 μL |
60 μL |
-20±5℃ |
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2X Multiplex PCR Buffer |
CSI01-C |
320 μL |
640 μL |
-20±5℃ |
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Primers Mix |
CSI01-D |
120 μL |
120 μL × 2管 |
-20±5℃ |
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Positive Templates Mix |
CSI01-E |
20 μL |
20 μL × 2管 |
-20±5℃ |
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Nuclease-free Water |
CSI01-F |
1 mL |
1 mL × 2管 |
-20±5℃ |
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DNA Marker |
CSI01-G |
80 μL |
160 μL |
-20±5℃ |
【注】:DNA Marker融化后于2-8℃保存,避免反复冻融。
有效期
规定储存条件下2年,具体详见试剂盒标签。
适用机型(包括但不限于)
经适用性验证的PCR扩增仪(包含定量PCR仪)
所需器材
仪器:移液器、漩涡混匀仪、瞬时离心机、高速离心机、PCR仪、恒温金属浴或恒温水浴锅、核酸电泳和成像相关设备
材料:1.5 mL无菌低吸附离心管、PCR管或八联管、低吸附带滤芯移液吸头、PBS(无菌)等
核酸电泳配套试剂:琼脂糖、核酸染料、TBE
操作过程
实验前请仔细完整阅读本说明书
- 细胞基因组DNA提取液制备
- 样本前处理
收集新鲜培养的待测细胞(总数为1×105 - 1×106)于1.5 mL离心管中,1000 rpm离心5 min尽可能弃掉培养基,在细胞沉淀中加500 μL PBS溶液轻微震荡重悬细胞。12000 rpm离心2 min,尽可能弃净上清。
【注】:建议此步骤结束后立即进行下一步检测;如果不能立即检测则将细胞沉淀置于可置-70℃及以下保存不超过6个月。
- 细胞裂解&基因组DNA提取
在每管待测样品中加入100 μL Cell Extraction Buffer,再加入2 μL的Proteinase K(20 mg/mL),立即漩涡震荡混匀。瞬时离心3-5 sec后,置于60℃金属浴中处理30 min,之后95℃处理5 min,即制备供试品基因组DNA提取液。冷却至室温后,12000 rpm离心2 min取上清作为后续PCR扩增的模板。
【注】:供试品基因组DNA提取液,置-20℃及以下保存,保存时间不超过1个月,避免反复冻融,如需多次使用,可分装保存。
- 阴性质控NCS制备
取无细胞的空白离心管,按照步骤2与待测样品同时进行操作。
- 多重PCR反应液配制与加样
- 多重PCR反应液制备(阴性区域)
2.1 根据所要检测的样品数量,计算所需反应孔数。
反应孔数=1个无模板对照NTC + 1个阴性质控NCS + 1个阳性质控(Positive Templates Mix)+ 待测样品数
2.2 根据反应孔数(增加1孔的损失量),将除模板外的组分混合成Mix反应液,各试剂置于冰上或低温下融化,轻微振荡混匀,瞬时离心3-5 sec,重复2-3次确保充分混匀,加样。
Mix反应液=(反应孔数+1)×12.5 μL 2X Multiplex PCR Buffer +(反应孔数+1)× 4.5 μL Primers Mix(含有1孔的损失量,如检测样本较多,可适当增加)
表2 Mix反应液配制表
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组分 |
单孔体积 |
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2X Multiplex PCR Buffer |
12.5 μL |
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Primers Mix |
4.5 μL |
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Total |
17 μL |
2.3 将Mix反应液充分混匀后按照17 μL/管分装至8联管或PCR管中。
- 阳性质控品工作液制备(阳性区域)
将试剂盒中的Nuclease-free Water和Positive Templates Mix置于低温或室温下融化,待完全融化后,轻微振荡混匀,瞬时离心3-5 sec,重复2-3次确保充分混匀。取18 μL Nuclease-free Water于一个新的1.5 mL离心管中,加入2 μL Positive Templates Mix,充分混匀后配成Positive Templates Mix工作液备用。
【注】:初次使用时建议将Positive Templates Mix分装储存,减少反复冻融次数和避免污染。
- 加样(阴性区域和阳性区域)
按照表3在相应管中加入8 μL样品。加完样品后每管体积为25 μL。
表3 各反应孔加样示例
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样品类型 |
加样示例 |
加样区间 |
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无模板对照NTC |
17 μL Mix反应液 + 8 μL Nuclease-free Water |
阴性区域 |
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阴性质控NCS |
17 μL Mix反应液 + 8 μL阴性质控NCS |
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阳性质控 (Positive Templates Mix) |
17 μL Mix反应液 + 8 μL Positive Templates Mix工作液 |
阳性区域 |
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待测样品 |
17 μL Mix反应液 + 8 μL供试品基因组DNA提取液 |
【注】:(1)Positive Templates Mix工作液是Positive Templates Mix用Nuclease-free Water稀释10倍所得。
(2)加样完成后密封好管子,低速离心后混匀再低速离心,完全混匀反应液,如有气泡,需将气泡排尽。
- 多重PCR反应
在PCR仪器上按照表4进行扩增程序设置。
表4 多重PCR反应程序
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步骤 |
温度 |
时间 |
循环数 |
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预变性 |
95℃ |
5 min |
1 |
|
变性 |
95℃ |
30 sec |
30 |
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退火 |
62℃ |
30 sec |
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延伸 |
72℃ |
30 sec |
|
|
再延伸 |
72℃ |
10 min |
1 |
|
保存 |
4℃ |
∞ |
1 |
- 琼脂糖凝胶电泳(电泳间)
- 制胶
检测所用的琼脂糖凝胶比例为2.5%,制胶所用托盘长度需≥60 mm。
2.5%凝胶(w/v)=(琼脂糖g/ 1 × TBE缓冲液mL)× 100% + 适量核酸染料
【注】:TBE的工作浓度为1×,配制工作液前请仔细观察母液是否有沉淀析出,如有析出请水浴加热(37℃)至沉淀完全溶解;如用粉末进行配制,则需确保粉末完全溶解。
- 点样
将8联管或PCR管瞬时离心后小心开盖。电泳上样量推荐6-10 μL,同时使用5 μL DNA Marker作为标记。
【注】:点样时请小心,避免戳破胶孔或溢出至其他孔道。
- 电泳
电泳液为1 × TBE缓冲液,100-150 V恒压电泳,至溴酚蓝至凝胶(凝胶长度约60 mm)边缘处停止电泳(时间约50 min至1.5 h)。使用凝胶成像仪分析电泳结果。
- 电泳结果判定
- 实验有效性判定
- 无模板对照NTC和阴性质控NCS应无扩增条带。
- 阳性质控10条扩增条带清晰可见,且条带大小应与图1泳道11分布一致。对应条带大小分别为猪464 bp、人394 bp、猫355 bp、中国仓鼠315 bp、恒河猴287 bp、非洲绿猴256 bp、大鼠200 bp、犬172 bp、小鼠147 bp、牛93 bp。


图1 细胞种属鉴别检测PCR产物电泳图
- 供试品结果判定
- 若待测样品的扩增子只有一个条带,且条带大小与目标细胞种属的扩增子条带大小一致,则可判定待测样品的细胞种属,且表明该样品无污染。
- 若待测样品的扩增子含有两个及以上条带,且条带大小与阳性质控品条带位置对应,则表明待测样品中含有其他种属细胞污染。与阳性质控的电泳条带进行对比,以判定污染的细胞种属。
- 为了结果的可靠性,建议对待检样品进行两次独立重复测试。
