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K-CSI01 细胞种属鉴别检测试剂盒(多重PCR法)

试剂盒简介

细胞种属鉴别是生物制品生产用细胞基质质量控制要求之一,也是保障生物制品生产使用正确细胞基质、防止细胞误用或交叉污染的重要措施。雅心细胞种属鉴别检测试剂盒(多重PCR法)可用于对细胞基质的物种来源进行鉴定,以确认细胞系身份以及是否存在其他细胞系的污染。本试剂盒基于多重PCR法和电泳技术,通过扩增动物细胞线粒体细胞色素b、细胞色素氧化酶COX )或细胞色素氧化酶COX )基因,根据PCR扩增子的大小鉴别细胞种属来源和污染情况。本法适用于猪、人、猫、中国仓鼠、恒河猴、非洲绿猴、大鼠、犬、小鼠和牛的细胞种属鉴别。如已知供试品的细胞种属信息且在多重PCR法可检测的种属范围内,可选择多重PCR法进行鉴别并判定是否存在其他种属来源细胞的交叉污染。

 

试剂盒组分

规格:25 Reactions50 Reactions

1  试剂盒组分

组分名称

组分编号

25 Reactions

50 Reactions

储存条件

Cell Extraction Buffer

CSI01-A

1 mL × 2

1 mL × 4

-20±5

Proteinase K (20 mg/mL)

CSI01-B

30 μL

60 μL

-20±5

2X Multiplex PCR Buffer

CSI01-C

320 μL

640 μL

-20±5

Primers Mix

CSI01-D

120 μL

120 μL × 2

-20±5

Positive Templates Mix

CSI01-E

20 μL

20 μL × 2

-20±5

Nuclease-free Water

CSI01-F

1 mL

1 mL × 2

-20±5

DNA Marker

CSI01-G

80 μL

160 μL

-20±5

【注】DNA Marker融化后于2-8℃保存,避免反复冻融。

 

有效期

规定储存条件下2年,具体详见试剂盒标签。

 

适用机型(包括但不限于)

经适用性验证的PCR扩增仪(包含定量PCR仪)

 

所需器材

仪器:移液器、漩涡混匀仪、瞬时离心机、高速离心机、PCR恒温金属浴或恒温水浴锅、核酸电泳和成像相关设备

材料:1.5 mL无菌低吸附离心管、PCR八联管、低吸附带滤芯移液吸头PBS(无菌)等

核酸电泳配套试剂:琼脂糖、核酸染料、TBE

 

操作过程

实验前请仔细完整阅读本说明书

  • 细胞基因组DNA提取液制备
  1. 样本前处理

收集新鲜培养的待测细胞(总数为1×105 - 1×106)于1.5 mL离心管中,1000 rpm离心5 min尽可能弃掉培养基,在细胞沉淀中加500 μL PBS溶液轻微震荡重悬细胞。12000 rpm离心2 min,尽可能弃净上清。

【注】建议此步骤结束后立即进行下一步检测;如果不能立即检测则将细胞沉淀置于可置-70℃及以下保存不超过6个月

  1. 细胞裂解&基因组DNA提取

在每管待测样品中加入100 μL Cell Extraction Buffer,再加入2 μLProteinase K20 mg/mL),立即漩涡震荡混匀。瞬时离心3-5 sec后,置于60℃金属浴中处理30 min,之后95℃处理5 min,即制备供试品基因组DNA提取液。冷却至室温后,12000 rpm离心2 min取上清作为后续PCR扩增的模板。

【注】供试品基因组DNA提取液,置-20℃及以下保存,保存时间不超过1个月,避免反复冻融,如需多次使用,可分装保存

  1. 阴性质控NCS制备

取无细胞的空白离心管,按照步骤2与待测样品同时进行操作。

  • 多重PCR反应液配制与加样
  1. 多重PCR反应液制备(阴性区域)

2.1 根据所要检测的样品数量,计算所需反应孔数。

反应孔数=1个无模板对照NTC + 1个阴性质控NCS + 1个阳性质控(Positive Templates Mix+ 待测样品数

2.2 根据反应孔数(增加1孔的损失量),将除模板外的组分混合成Mix反应液,各试剂置于冰上或低温下融化,轻微振荡混匀,瞬时离心3-5 sec,重复2-3次确保充分混匀,加样。

Mix反应液=(反应孔数+1×12.5 μL 2X Multiplex PCR Buffer +(反应孔数+1× 4.5 μL Primers Mix(含有1孔的损失量,如检测样本较多,可适当增加)

 

 

 

2  Mix反应液配制表

组分

单孔体积

2X Multiplex PCR Buffer

12.5 μL

Primers Mix

4.5 μL

Total

17 μL

2.3 Mix反应液充分混匀后按照17 μL/分装至8联管或PCR管中。

  1. 阳性质控品工作液制备(阳性区域)

将试剂盒中的Nuclease-free WaterPositive Templates Mix置于低温或室温下融化,待完全融化后,轻微振荡混匀,瞬时离心3-5 sec,重复2-3次确保充分混匀18 μL Nuclease-free Water于一个新的1.5 mL离心管中,加入2 μL Positive Templates Mix,充分混匀后配成Positive Templates Mix工作液备用。

【注】初次使用时建议Positive Templates Mix分装储存,减少反复冻融次数和避免污染

  1. 加样(阴性区域和阳性区域)

按照表3在相应管中加入8 μL样品。加完样品后每管体积为25 μL

3  各反应孔加样示例

样品类型

加样示例

加样区间

无模板对照NTC

17 μL Mix反应液 + 8 μL Nuclease-free Water

阴性区域

阴性质控NCS

17 μL Mix反应液 + 8 μL阴性质控NCS

阳性质控

Positive Templates Mix

17 μL Mix反应液 + 8 μL Positive Templates Mix工作液

阳性区域

待测样品

17 μL Mix反应液 + 8 μL供试品基因组DNA提取液

【注】1Positive Templates Mix工作液Positive Templates MixNuclease-free Water稀释10倍所得

2加样完成后密封好管子,低速离心后混匀再低速离心,完全混匀反应液,如有气泡,需将气泡排尽。

  • 多重PCR反应

PCR仪器上按照表4进行扩增程序设置

4  多重PCR反应程序

步骤

温度

时间

循环数

预变性

95℃

5 min

1

变性

95℃

30 sec

30

退火

62

30 sec

延伸

72℃

30 sec

再延伸

72℃

10 min

1

保存

4

1

 

  • 琼脂糖凝胶电泳(电泳间)
  1. 制胶

检测所用的琼脂糖凝胶比例为2.5%,制胶所用托盘长度需≥60 mm

2.5%凝胶(w/v=(琼脂g/ 1 × TBE缓冲液mL× 100% + 适量核酸染料

【注】TBE的工作浓度为配制工作液前请仔细观察母液是否有沉淀析出,如有析出请水浴加热(37℃)至沉淀完全溶解;如用粉末进行配制,则需确保粉末完全溶解。

  1. 点样

8联管或PCR管瞬时离心后小心开盖。电泳上样量推荐6-10 μL,同时使用5 μL DNA Marker作为标记。

【注】点样时请小心,避免戳破胶孔或溢出至其他孔道。

  1. 电泳

电泳液为1 × TBE缓冲液,100-150 V恒压电泳,至溴酚蓝至凝胶(凝胶长度约60 mm)边缘处停止电泳(时间约50 min1.5 h)。使用凝胶成像仪分析电泳结果。

  • 电泳结果判定
  1. 实验有效性判定
    1. 无模板对照NTC和阴性质控NCS应无扩增条带。
    2. 阳性质控10条扩增条带清晰可见,且条带大小应与图1泳道11分布一致。对应条带大小分别为猪464 bp、人394 bp、猫355 bp、中国仓鼠315 bp、恒河猴287 bp、非洲绿猴256 bp、大鼠200 bp、犬172 bp、小鼠147 bp、牛93 bp

1  细胞种属鉴别检测PCR产物电泳图

  1. 供试品结果判定
    1. 若待测样品的扩增子只有一个条带,且条带大小与目标细胞种属的扩增子条带大小一致,则可判定待测样品的细胞种属,且表明该样品无污染。
    2. 若待测样品的扩增子含有两个及以上条带,且条带大小与阳性质控品条带位置对应,则表明待测样品中含有其他种属细胞污染。与阳性质控的电泳条带进行对比,以判定污染的细胞种属。
    3. 为了结果的可靠性,建议对待检样品进行两次独立重复测试。